提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
四川洪雅瓦屋山景区索道经抢修恢复运行 景区向游客道歉******
中新网眉山1月30日电 (记者 刘忠俊)四川洪雅县瓦屋山景区1月29日深夜发布公告称,经全力抢修该景区高山区索道恢复运营。同时,景区向此前因索道故障受到影响的游客们道歉。
1月27日14时55分,洪雅瓦屋山景区古佛坪索道突发不可预判的电机烧坏故障,导致许多游客滞留山上。故障发生后,该景区迅速启动了应急预案,启用备用电机运送游客,于当日22时左右将滞留在山上的游客全部安全送下山。
与此同时,瓦屋山景区迅速联系了北京、上海技术专家团队和设备,并于1月28日中午抵达景区,对古佛坪索道开展紧急抢修和设备更换。目前,经专家团队不懈努力,古佛坪索道已通过安全测试,1月30日起正式恢复运行。
抢修人员正在加紧设备抢修作业。 石天权 摄瓦屋山景区在致游客的信中称,虽然景区为游客提供了免费姜汤、面包等必要物资,但仍给游客带来了诸多不便,影响了游客的旅游体验、节日心情和行程安排,景区深深自责和歉意,感谢游客们的包容和理解。
雪地里拉着抢修设备的工作人员。 石天权 摄景区同时称,为表达歉意,2023年1月27日入园的所有游客,以及预定了1月28日入园的游客,从即日起至2025年12月31日(三年有效期),本人持身份证入园可免费游览瓦屋山景区一次(免费内容含:门票+金花桥索道+古佛坪索道),该政策享受人群以景区票务系统采集的身份信息为准。
洪雅瓦屋山景区表示,感谢游客们的理解与支持,以及提出的宝贵建议和批评意见的游客。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |